Din que o home é o único animal que tropeza dúas veces nas mesmas pedras. As máquinas evolucionarán perfeccionándose, pero nos seguimos cumplindo este principio. Tiven que recordar como se configuraba tomcat+mysql en Sarge para programar aplicacións JSP e creei este documento para que a seguinte vez non necesite volver a tropezar.
Aqui facilito o documento: jsp_tomcat_mysql_debian.pdf

java-package

Pode darse o caso de necesitar ter diferentes versions de java instaladas na máquina, para poder facer probas de programación,etc. Quizais a primeira opción sería metelos todos en /opt e sería perfectamente válido. Outra opción sería empaquetalos nun paquete debian, e instalalos no sistema.